假如用于在仓库货架长进行货物碓码，要选择耐久性强、不易变形、静载量大的木托盘。这样的托盘一般是四面方向进叉、田字结构的双面托盘。
假如用于频繁地运输、搬运和装卸工作，要选择刚性强、硬度强、动载量较大的木托盘。这样的托盘一般是两面或四面方向进叉、日字或川字结构的单面托盘。
首先，存放木托盘的厂房要应保持干净卫生，而且要随时注意通风，这样有利于木托盘存放在干燥的环境下，防止腐烂。
其次，易燃品、易爆品或违禁品严禁带入仓库，在仓库的外侧要有明确的标志，而且还要有专门的人员进行检查。这尤其需要注意，因为木托盘是木材原料，而且干燥，记忆点燃导致火灾发生。造成大量的财产损失和人员伤亡。
免熏蒸托盘的价格会比熏蒸木托盘低，因为每个木托盘都需要熏蒸和消 毒，并且需要申请熏蒸证书。每个托盘将增加熏蒸费5-15元左右，免熏蒸托盘的成本更具优势。
热处理的木托盘用于在高温下的热处理室内杀死昆虫，木材的核心温度需要至少达到70摄氏度，并持续15小时。..代码是HT。因此，现在常见的是在木托盘上看到包含HT徽标的IPPC标志，它代表了经过热处理的木托盘。